フォクシーが教団員を捕らえるところからゲームがスタート。
シオンが自由に動けるようになったらクリューヌ城内の左のほうにある部屋に行きフォクシー＆ダグと会話。
その後教団員が捕まってる部屋へ。
その後王室へ。
教団員が脱獄したら、町を出て巨人の塔へ

巨人の塔最上階で巨人族のスルトとの戦闘（イベントバトル）
このイベント戦で、シオンは片目を失う代わりに、赤い封印された宝箱を開けることが出来るようになります。

巨人の塔でテュールが仲間になる。
巨人の塔でヒューイの肩身であるヒューイリングが手に入ります。
テュールを助け部屋を出るところで巨人族のルドラが復活する。

ダヌルフから武人の塔へ。
対戦相手はネルガルで、戦闘方法を1vs1か3vs3か選べます。
勝利後大気の浄化が起こる。
この後ダヌルフから言霊山へ。

武人の塔二回戦目の対戦相手はアマティスタです。
アマティスタとの戦いは言霊戦か肉弾戦かを選ぶことができます。
戦闘に勝利した後定期船を使い、オムロパスへ･･･。
ヌークは左下の道具屋にいます。
ヌークにあってデルフィ山からテューラ遺跡へ。

武人の塔最終戦は謎の武道家です。
戦闘勝利後、台座が浮遊し天空へ･･･。

ジグムンド氷山 (ここでラミレスと別れる)
↓
レン
↓
ダナン宮殿（スルトに会う）
↓
アヴドルに異変が起き世紀末の魔物が復活するイベントを見る。
↓
列車でギャラルトンネルへ
↓
ギャラルトンネル内で大岩バドラとの戦闘。
ギャラルトンネル→時計塔

時計塔の敵は癖があるやつが多いので注意が必要。
隠し通路みたいになってて見にくいところもあるので注意。
尚一部アイテムは取り逃すと、時計塔から出る際にデューンに持ってかれてしまう。
モンジュを倒したら時計塔を抜け、列車へ。

列車を降り、フィールドに出てグラム遺跡へ。
複雑そうに見えて、単純な構造になっているグラム遺跡。
グラムソードの部屋の直前で、マーリーチャとの戦闘に。
マーリーチャを倒し、グラムソードを取ったら列車へ

列車を降り、フィールドに出てフレイ遺跡へ。
オプシスを倒したら列車へ。

ダナン聖域
列車を降りて、即効ダナンの遺跡を入らずに、付近を探索すると「ガサガサ」と音がします。
音がした後入り口付近の森を調べると、悪霊系のモンスターであるトリフィドとの戦闘になり、倒すと暗黒刀が手に入ります。
ダナンの聖域の敵は陽属性のため、かなり有利に進めるでしょう。
落とし穴から落ちると、宝箱が四つありますが、二つはアイテムで、もう二つはモンスターが入っています。
この宝箱モンスターは、陰属性なので、宝箱を開ける前に装備を変更しておきましょう。
奥の部屋でマユラとの戦闘になります。
マユラを倒すとダナン聖域の宝が消えてしまうので注意。
マユラを撃破後外に出ると天空落下が起こる

天空落下後、町に不思議な光が。
レンの町の外にいた人々が消えていて、宮殿のほうに向かっても警備の人影もない。
不思議に思いながら急いでスルトのところへ行き話を聞くと”最後の浄化”が始まったという･･･。
ここで、ロスタム・ヒューイを失った恨みを晴らすべくスルトとの戦闘に。

最後のダナン4神であるディヤウスに会うため、再びジグムンド氷山へ。
ジグムンド氷山では、数体の雪男が罠を仕掛けていますが、罠にかかって損はしないことが多いので、どんどん引っかかってください。
ダナンの石像の先にある二度進まれよ･･･ですが、一度進み一度戻るとアイスソードが手に入ります。
頂上で剣のところまで行くと、ディヤウスが登場し戦闘になります。

へグの体内へ･･･
へグの体内の敵はステータス異常である汚染を引き起こすやつもいるので倒さないほうが無難かもしれません。

アヴドルに到着後へグの体内を浄化するべくエレミア館へ。
ところが、エレミア館へ入るとそこは魔物の巣窟に。
フォクシの父親が避難しているオリアブの民家で聖杯の話を聞き、再びアヴドルへ向かいましょう。
※エレミア館に寄らず、直接オリアブで父親に会ってもよい
アヴドルに到着すると謎の教団に遭遇。謎の教団員の後を追いラゴウ石研究所へ。
謎の教団員がエレベータを降りた後、エレベータを調べ下の階へ。
ミュンヒ博士の遺体を調べ、エレベータに向かうとナーギャとの戦闘になります。
このあとフォクシーを蘇生させるべく隠れ里へ･･･。
隠れ里へは、アヴドルのヘグの祠からヘグに乗っていけます。

迷いの森のすすみ方は「左・上・右・下」です。
長老に会い、その後リザから復活薬を貰い、フォクシーを生き返らせましょう。
その後、口伝師に話を聞き樹海からオリアブへ。

オリアブで伝言板を見た後、定期船でオムロパスを経由してダヌルフへ。
ダヌルフ到着後、クリューヌ城へ行き、教会へ。
その後クリューヌ王に会う。

ダヌルフから小船を使って言霊山へ。

言霊山で謎の教団員＆ラーヴァナと戦闘。

ルドラ教へ潜入。
途中でターレスと再会しますが、奥までいくと教祖に取り憑かれたターレスとの戦闘になります。
このあとターラクの酒場でサーレントと取引を行い、いよいよシュミセンへ

ターラクの酒場の取引ついて
出来る限りちゃんと取引を行ってください。
取引を行わない・盾を譲るを選んだ場合は、シオンの章のルドラが異常に強くなります。

シュミセンへ。
シュミセンでは多数のワープゾーンと、隠しアイテムがあります。
アイテムの取りこぼしは無いように。
奥に進みルドラと対決。
ルドラを倒した後、床の底が抜け、ガフの間へ。
ルドラを倒すとすぐにゴモラ戦です。
ゴモラ戦に入る前に必ずルドラ戦で消耗したライフなどを回復させておきましょう。
ゴモラは召還する三人の手下を倒さなければダメージを与えることはできないので、召還する手下を倒しましょう。
なお、手下を召還している間は、強力な言霊攻撃は行わないので、セレナリームをかけておけばまず大丈夫でしょう。